《電子技術(shù)應(yīng)用》
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SHANEL技術(shù)現(xiàn)身,可對人體器官實現(xiàn)快速、完整的組織透明化

2020-02-28
來源:與非網(wǎng)
關(guān)鍵詞: SHANEL 顯微鏡 3D圖像

  2 月 28 日訊,還記得讓大家驚嘆不已的“看清全身所有癌癥轉(zhuǎn)移灶”嗎?搞出這種震撼畫面的德國組織工程和再生醫(yī)學(xué)研究所研究團(tuán)隊,時隔兩個多月又放出了大招。

  近年來生物學(xué)家已經(jīng)獲得了小鼠某些器官的完整細(xì)胞結(jié)構(gòu)圖,可是使用的方法不適用于人體器官。因為人類器官比小鼠器官生長的年限長得多,里面的膠原成分已經(jīng)長了幾年甚至幾十年,用于讓小鼠器官透明的藥劑不足以讓人類器官變得透明。

  這項由德國亥姆霍茲研究中心協(xié)會(Helmholtz Association of German Research Centres)組織的研究,經(jīng)過多次嘗試,終于找到一種名為 CHAPS 的藥劑,先在人類器官上打出很多洞,再用另一種藥液注入器官內(nèi)部,把器官變成透明的結(jié)構(gòu)。這份研究使用的是死者的器官。

  之后,研究組還發(fā)明了一種能容納整個器官進(jìn)行掃描的激光掃描顯微鏡,能掃描大如人體腎臟的器官。接下來,使用合作方德國慕尼黑工業(yè)大學(xué)(Technical University of Munich)提供的一套人工深度學(xué)習(xí)算法,分析數(shù)億張三維細(xì)胞圖片。

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  研究人員表示,這項技術(shù)很快將發(fā)展成掃描人體完整器官的主流技術(shù),將顯著提升研究人員對大腦這樣器官的功能性健康和疾病的認(rèn)知。

  人體器官細(xì)胞圖還是將來三維生物打印的重要基礎(chǔ)。為了實現(xiàn)這個目標(biāo),慕尼黑路德維希·馬克西米利安大學(xué)(Ludwig Maximilian University,LMU)的埃爾圖克(Ali Ertürk)和同事正在從胰腺、心臟和腎臟這些人體的主要器官著手制圖。

  “幾十萬人都面臨器官短缺的問題,”埃爾圖克說,“等待時間和移植成本是大問題。人體器官細(xì)胞結(jié)構(gòu)圖為我們實現(xiàn)按需制造器官的目標(biāo)邁進(jìn)了重要的一步。”

  在最新一期的《細(xì)胞》上,Ali Ertürk 教授帶領(lǐng)的研究團(tuán)隊發(fā)表論文,介紹了一種名為 SHANEL 的全新技術(shù),這種技術(shù)讓人類第一次在細(xì)胞層面,對人體各種器官實現(xiàn)了快速、完整的組織透明化!

  這意味著什么呢?小到組織切片,大到完整的人體器官,都能在這種技術(shù)下變得完全透明化,科學(xué)家們能夠?qū)⑵鞴僦械拿恳粋€細(xì)微之處,都在 3D 圖像上精確到細(xì)胞水平,而且速度也比過去大幅提升了!

  SHANEL 技術(shù)的誕生,能夠加速人類對人體器官的了解,甚至有望為傳說中的 3D 打印人體器官鋪路!

  是不是很科幻,很酷炫呢?下面奇點糕就來說說這項技術(shù)的原理吧。

  想要毫無阻礙地從細(xì)胞層面觀察人體器官,需要解決很多問題。有人可能會問,不是可以做組織切片,在顯微鏡下去看嗎?那是不知道組織透明化(Tissue Clearing)有多費(fèi)事。

  過去想要讓厚度超過 1 毫米的切片透明,都相當(dāng)費(fèi)時費(fèi)力,直到近幾年,才有一些新技術(shù)突破了厚度的瓶頸,但制備好一片厚度 8 毫米的人腦切片,就得需要 10 個月的時間[2]。

  問題的關(guān)鍵是什么呢?是人體器官周圍堆積的不可溶性膠原蛋白、脂褐素等物質(zhì),遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于小鼠之類的動物,這嚴(yán)重阻礙了化學(xué)染料的穿透。連讓器官透明化都難,就更別說實現(xiàn)分子標(biāo)記、輔助成像了。

  用本次論文第一作者 Zhao Shan 的話說,“我們必須徹底改變方法,從零開始尋找讓人體器官透明的化學(xué)物質(zhì)”。研究團(tuán)隊找到了一種簡稱 CHAPS 的組織清洗劑,它可以聚集成小膠束,快速穿透和清除器官周圍致密的屏障。

  SHANEL 的全稱——小膠束介導(dǎo)的人體器官透明化和標(biāo)記(small-micelle-mediated human organ efficient clearing and labeling),就是來自 CHAPS 形成的這個小膠束。

  在豬腦等器官的實驗證實了初步的效果后,接下來研究人員用人的大腦進(jìn)行了 CHAPS 清洗劑的最終測試。

  花費(fèi) 4 個月的時間和約 3200 歐元的費(fèi)用后,大腦第一次“見了光”,清晰、透光,3D 圖像的重建也變成了現(xiàn)實。

  不過有了新技術(shù),還要解決一系列的新問題,比如小分子熒光染色和抗體標(biāo)記手段,過去用在毫米級組織切片上的東西,放到厚度厘米級的完整器官上,就得與時俱進(jìn),研究團(tuán)隊都做了相應(yīng)的改進(jìn)。

  解決了標(biāo)記和染色,接下來就是顯微鏡的問題,總不能把一整個大腦搬到現(xiàn)有的顯微鏡下觀察吧?就算切成厘米級的切片,也超越了普通顯微鏡的能力。

  研究團(tuán)隊找出了一種名叫原型光片顯微鏡(Prototype light-sheet microscope)的大家伙,它的容積可以直接放置經(jīng)過 CHAPS 處理后的甲狀腺、腎臟等整個器官。

  最后為了分析和處理 SHANEL 技術(shù)帶來的龐大信息量,研究團(tuán)隊借助了深度學(xué)習(xí)算法,實現(xiàn)了在幾小時內(nèi),完成對每部分腦切片(約 1.5 厘米厚)中,1000-2200 萬個腦細(xì)胞的分類和圖像繪制。

  費(fèi)了這么多功夫,SHANEL 技術(shù)當(dāng)然也要派上大用場。研究團(tuán)隊在論文中舉了一個例子,像是 2 型糖尿病當(dāng)中,胰島在細(xì)胞層面發(fā)生的微觀改變,靠現(xiàn)有的手段還很難整體分析,但是 SHANEL 技術(shù)就可以完整繪圖,清晰判斷。

  目前研究團(tuán)隊已經(jīng)開始把這項技術(shù),用于胰臟、心臟、腎臟等較大器官的 3D 圖譜繪制,Ali Ertürk 教授認(rèn)為,只有在細(xì)胞層面把這些器官徹底了解,才能解決人工制造器官的問題,從而為 3D 生物打印器官用于器官移植鋪路[3]。


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