《電子技術(shù)應(yīng)用》
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基于CMOS的生物芯片提供的優(yōu)勢

2022-08-31
來源:MEMS
關(guān)鍵詞: CMOS 生物芯片 生物傳感器

  據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,近日,開羅美國大學(xué)(The American University in Cairo,AUC)設(shè)計(jì)了一種基于CMOS生物芯片,該生物芯片由電容傳感器矩陣(matrix of capaciTIve sensors,CSM)組成,利用基于環(huán)形振蕩器的像素讀出電路(pixel readout circuit,PRC)根據(jù)單個(gè)生物細(xì)胞的不同特征(如生物細(xì)胞的位置、形狀和電容)對其進(jìn)行追蹤和表征。研究人員對所設(shè)計(jì)的生物芯片進(jìn)行了仿真,以表征單個(gè)肝細(xì)胞癌細(xì)胞(Hepatocellular carcinoma cell,HCC)和單個(gè)正常肝細(xì)胞(normal liver cell,NLC)。COMSOL MulTIphysics軟件用于提取HCC和NLC的電容值,并測試CSM在與分析物不同距離處的性能。通過Virtuoso Analog Design Environment軟件評估PRC檢測已提取的HCC和NLC電容值的能力。研究人員也開發(fā)了一種新算法,利用MATLAB R2022a腳本,根據(jù)CSM的電容讀數(shù),對被測生物細(xì)胞的位置和形狀進(jìn)行預(yù)測和動(dòng)畫顯示。兩種模型的結(jié)果,即CSM測量的電容和讀出電路的相關(guān)頻率,顯示了生物芯片表征和區(qū)分HCC和NLC的能力。

  在物理驅(qū)動(dòng)或細(xì)胞培養(yǎng)條件下,監(jiān)測和可視化細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)和生長是許多生物科學(xué)家的重點(diǎn)研究領(lǐng)域。生物傳感器被廣泛使用,因?yàn)樗鼈兡軌蛲ㄟ^動(dòng)態(tài)、無創(chuàng)測量生物體液(如汗液、眼淚、唾液和間質(zhì)液)中生物細(xì)胞的物理特性來提供連續(xù)、實(shí)時(shí)的生理信息。此外,它們還具有精度高、速度快、便攜性高、成本低和功耗低等特點(diǎn)。這使得集成芯片在此類應(yīng)用方面有別于傳統(tǒng)方法,例如顯微圖像的圖像處理,后者更復(fù)雜,缺乏便攜性,成本更高。

  基于CMOS技術(shù)實(shí)現(xiàn)的生物傳感器可提供高通量的優(yōu)勢。CMOS技術(shù)還具有許多其他優(yōu)勢,例如能夠?qū)⒋罅總鞲衅髋c其相關(guān)的電子電路集成,以創(chuàng)建單芯片實(shí)驗(yàn)室(Laboratory on Chip,LOC),從而減少生物分析(如DNA分析、癌癥檢測、連續(xù)血糖監(jiān)測和神經(jīng)化學(xué)檢測)所消耗的時(shí)間。

  基于CMOS的電容傳感器不僅結(jié)構(gòu)緊湊,而且在許多生物應(yīng)用中也具有高靈敏度。電容傳感器依賴于檢測電容電極上方或電極之間的介電性能變化。當(dāng)細(xì)胞被引入電容傳感器上方時(shí),由于細(xì)胞膜中的離子云而引起介電性能改變。這種改變很小,因此需要使用靈敏的電容讀出電路進(jìn)行測量。然而,先前在基于CMOS的電容傳感器領(lǐng)域的研究主要集中于分析物表征或成像。

  本次研究的目的是利用高密度雙電極電容傳感器陣列、基于高頻環(huán)形振蕩器的讀出電路和預(yù)測測試細(xì)胞形狀的新腳本(使用三次樣條插值),對生物細(xì)胞進(jìn)行表征和成像。作為概念證明,開羅美國大學(xué)提出了一種新的基于電容的生物芯片,用于定位、表征和預(yù)測生物細(xì)胞的形狀。這項(xiàng)工作的重點(diǎn)是區(qū)分單個(gè)肝細(xì)胞癌細(xì)胞(HCC)和單個(gè)正常肝細(xì)胞(NLC)。這種生物芯片由四個(gè)主要部分組成,一個(gè)10×10電容傳感器矩陣(CSM)、一個(gè)像素讀出電路(PRC)、一個(gè)微流控腔室和一臺(tái)個(gè)人計(jì)算機(jī)。與之前的工作不同,CSM的設(shè)計(jì)具有頂部接地板,以確保沒有干擾讀數(shù)的噪聲。通過有限元法(FEM),特別是COMSOL MulTIphysics 5.5,對CSM進(jìn)行仿真。在Virtuoso Analog Design Environment - Cadence上設(shè)計(jì)和仿真的PRC使用基于高頻環(huán)形振蕩器的讀出電路,其數(shù)字頻率輸出可使用計(jì)數(shù)器測量,無需模數(shù)轉(zhuǎn)換器(ADC)。在高頻下工作可以提高傳感器的靈敏度,因?yàn)檩^小的電容變化會(huì)導(dǎo)致輸出頻率發(fā)生顯著的變化。因此,該電路的復(fù)雜性和功耗較低,使其適合大規(guī)模制造。該計(jì)算機(jī)用于運(yùn)行一種新算法,該算法使用MATLAB R2022a利用來自CSM的電容讀數(shù)來定位、表征和預(yù)測生物細(xì)胞的形狀。

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  生物芯片平臺(tái)的框圖

  這項(xiàng)研究是第一個(gè)專注于生物傳感器陣列中被測生物細(xì)胞的形狀預(yù)測的研究,而其他研究則只處理電容讀數(shù)。此外,研究人員還積極尋找和消除由于傳感器矩陣或電路可能發(fā)生的任何故障的影響。這些故障包括微流控通道內(nèi)被測生物細(xì)胞的高度、傳感器對生物細(xì)胞存在的敏感性、溫度和電壓變化的影響以及寄生電容的影響。

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  (a)預(yù)估細(xì)胞形狀的步驟;(b)基于COMSOL MulTIphysics的CSM讀數(shù)在不同位置形狀的NLC和HCC的形狀預(yù)估。

  然而,這些誤差的影響已通過以下方式消除:添加了一個(gè)接地頂板,以增強(qiáng)傳感器對生物細(xì)胞存在的敏感性;設(shè)計(jì)了一個(gè)微流控腔室,用于將測試的生物細(xì)胞保持在一定高度;使用鹽水作為參考,對電容讀數(shù)進(jìn)行歸一化,以消除諸如寄生電容、溫度變化和電壓變化等讀出電路誤差的影響。

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  模擬CSM的不同配置,以確定用于感測細(xì)胞電容的最有效配置

  這項(xiàng)研究中的CSM對幾種類型和大小的生物細(xì)胞(例如,懸浮在鹽水中的NLC和HCC)進(jìn)行建模和測試。來自兩個(gè)模型(CSM和讀出電路)的測量電容及其相關(guān)頻率的結(jié)果證明了所提出的架構(gòu)能夠區(qū)分不同類型和大小的生物細(xì)胞(NLC和HCC)。使用MATLAB R2022a開發(fā)了一種新算法,以動(dòng)畫模擬細(xì)胞的運(yùn)動(dòng),并使用CSM測量的電容預(yù)測被測細(xì)胞的形狀和位置。結(jié)果表明,所開發(fā)的算法成功地估計(jì)了NLC和HCC的位置和大小,準(zhǔn)確率接近100%。此外,這種監(jiān)測允許在沒有外部設(shè)備(如光學(xué)顯微鏡)的情況下預(yù)估其他附加特征,例如被操縱粒子的速度和體積。最后,利用基于環(huán)形振蕩器的電容傳感器矩陣開發(fā)了一種用于監(jiān)測和識(shí)別生物細(xì)胞的完全集成生物芯片,該芯片具有效率高、體積小、成本低等諸多優(yōu)點(diǎn),并且無需樣品標(biāo)記和外部設(shè)備。這項(xiàng)工作證明了作為適用于表征和成像的生物芯片概念的可行性。



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