云存儲目前主要面臨的問題有：寬帶瓶頸、安全性、可用性和基礎設施
1. 寬帶瓶頸
考慮到過去20年中，寬帶提升和數據增長的差距更為惡化，寬帶很有可能是阻礙云存儲被當做標準商業化應用普及的最大障礙。對于典型的個人消費者而言，互聯網寬帶從28.8k modem提升至5Mbps左右，提升幅度超過170倍。但是與此同時數據增長卻從先前的大約每個用戶平均100MB暴增至超過1TB，其增幅竟然超過1 萬倍。隨著這種差距的逐漸擴大，裝置外存儲(offsite storage)作為主要數據存儲途徑的可行性越來越小。
2. 安全性和可用性
除寬帶之外，其他限制性因素包括可靠性和安全性也在議事日程上不可忽視。將數據遷移至云中致使企業用戶在數據安全性和可用性方面高度受制于其云存儲服務器供應商。讓眾多企業將其數據遷移至云中非常艱難。可以說安全性和可用性的擔憂是企業走向云存儲模式的至高無上的因素。
一個是在網絡上提供云存儲或云計算資源的連接性缺乏控制。因此，用戶以為所有傳送的數據可能被截取或更改。結果，任何敏感的信息如登陸ID和密碼都應該被保護。這種安全問題現在作為一種云服務，一般由電子郵件和CRM主應用程序提供。
在過去，安全指的是周邊安全，確保周邊不允許未經授權的訪問。在一個虛擬世界，通過虛擬IT服務，一個物理周邊已經不復存在了。因此，企業必須假設所有傳輸的數據可能潛在的被截取。一個系統上沒有物理控制，這些規則的執行必須依賴其他方法來限制信息的訪問。加密是限制訪問有意義的信息的一種重要的方法。因此，當IT服務通過云交付時，加密成為了安全的一個重要組成。云存儲的問題非常有挑戰性，因為數據必須以加密的形式存儲和保存。如果加密密鑰本身丟失或損壞，數據本身也就相應的丟失或損害了。
3. 基礎設施
性能不一定要求越高越好，而是有多種性能區以供用戶選擇，但基本上還是要滿足較低延遲，早期的云計算平臺在由于忽略對后端存儲投入而出現比較多的 IO延遲。另外，被存儲的數據中有70%是靜態的，很少甚至不會再次被訪問，那么將這些數據通過自動化的 ILM(信息生命周期管理)沉降到更低成本的介質上去，企業能夠節省成本。為了做到這些，必須使用基于策略的塊級ILM方法，卷級和文件級的自動遷移達不到設想的效果，只有顆粒度細化到數據塊級，才可能做到對應用的隨需相應。數據保護的重要性就更不用多說，對于存儲來說，數據安全是第一位的，尤其是企業用戶。
解決了以上的三個問題，云存儲也就適應了商業化信息存儲庫的需要。初始的備份可以在裝置內完成，也可以在云存儲上另作備份獲得裝置外的數據保護。